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无缝克隆 (同源重组)

V112 One Step Gibson Cloning Kit (可连接1-5个片段) ★★★

无缝克隆,可连接1-5个片段
货号 产品名称 规格 价格 优惠价
V112-10V112 One Step Gibson Cloning Kit (可连接1-5个片段) ★★★10次320元 256元
V112-50V112 One Step Gibson Cloning Kit (可连接1-5个片段) ★★★50次1100元 880元
V112-100V112 One Step Gibson Cloning Kit (可连接1-5个片段) ★★★100次1890元 1512元
产品简介

One Step Gibson Cloning Kit是根据Gibson原理的无缝克隆技术研制而成,可简单、快速、高效地将目的片段定向克隆至载体的特定位点。

仅需设计15-25bp同源臂,一次实现1-5个片段重组,形成长度达48kb的重组质粒。一管式mix,兼容高低片段投入量(0.003-0.25pmol)、高低GC同源臂、纯度差/未纯化样本等。


金百特 Gibson无缝克隆

每一次试验均能为你节省80分钟!    随便挑一个都是阳性!      让你从此爱上无缝克隆!成就感爆棚!


配制连接体系(酶切原液、PCR原液)---50℃连接30min---加入感受态---冰浴5min---42℃热激1min---冰浴2min---复苏15min---涂板

举例(直接用 酶切原液、PCR原液 配制连接体系)

① 8k载体8ug,用50ul体系酶切,酶切后160 ng/ul,无缝克隆加3 ul载体酶切原液(不做胶回收);

② PCR扩增35个循环,此时默认PCR原液的浓度是300 ng/ul,目的条带单一的话,不用切胶纯化,无缝克隆加2 ul PCR原液;

③ 加入5 ul 2x无缝克隆mix,50度抚育30 min。


配制连接体系(纯化后的载体、DNA片段)---50℃连接15min---加入感受态---冰浴5min---42℃热激1min---冰浴2min---复苏15min---涂板


独特优势:

1、Gibson优秀的设计原理,杜绝外源基因(细菌DNA片段)片段插入,为你从源头消除隐患!

2、无需PCR纯化,支持直接用酶切原液、PCR原液(目的条带单一)直接配制无缝克隆反应体系!

3、体外即可达到闭合环状质粒,减少转化时与感受态的摩擦力,转化率高,长斑多,阳性率高!


Gibson原理:

Gibson Assembly原理的cloning mix包含3种酶,分别是T5 exonuclease、Phusion DNA polymerase和Taq DNA Ligase,它们协同作用:首先利用T5 exonuclease的5’→ 3’外切酶活性,产生3’黏性末端,之后同源臂进行互补配对,再利用Phusion DNA polymerase延伸补齐片段上的缺口部分,最后通过Taq DNA Ligase连接DNA片段中的缺刻,完成克隆组装得到一个闭合环状的质粒。(与单一重组酶的mix相比,Gibson采用3种酶协同作用,效率更高,而且避免了在缺刻处插入外源基因的风险。)

Gibson原理图.png

紫红色和绿色2个片段为需要连接的双链DNA片段,它们末端有相同的15-25个重叠序列(黑色)


同源臂设计示例:

(1). 单个插入片段克隆引物设计:克隆引物包括插入片段特异性引物序列和重叠序列。

克隆正向引物(5’-3’):线性载体正向16-25 nt重叠区序列(3’末端算起)+插入片段正向特异引物序列(18-25 nt)

克隆反向引物(5’-3’):线性载体反向16-25 nt重叠区序列(3’末端算起)+插入片段反向特异引物序列(18-25 nt)

注意:重叠区的碱基数至少15 bp,并且多段重叠区域之间的Tm值需保持一致且﹥60°C (AT pair = 2°C and GC pair = 4°C),否则可延长碱基数目直到符合要求。计算扩增引物退火温度时,只需计算基因特异性扩增序列的Tm值,载体末端同源序列不应参与计算。

按照线性载体末端的结构(5’突出,3’突出,平末端),引物设计也分3种情况,示意如下:

V112同源臂设计示意图.jpg

线性化载体的两端因线性方式(如单酶切、双酶切、反向PCR)不同,可以是以上三种末端结构的两两任意组合,插入片段特异性引物设计的原则遵循一般引物设计的原则即可。


正向引物设计举例说明(EcoR I 酶切开):

 正向引物设计举例说明(EcoR I 酶切开).png

如上图,载体由Ecor I 酶切开,形成5’突出末端:

根据上述设计原则,从3’端开始计算,往回算15bp-25bp(本举例采用了20 bp末端重叠相同序列),加到目的片段特异引物序列前面即可。确保重叠区域的Tm值保持一致且﹥60°C (AT pair = 2°C and GC pair = 4°C)。

正向引物具体如下:5' — GAGCCTAGGTGAGTTGGCCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN —3'

注意:以上引物设计完成克隆连接后,EcoR I 酶切位点将会消失(不保留酶切位点)。


如果需要保留 EcoR I 酶切位点,需要在载体末端20 bp重叠序列和目的片段特异引物序列之间补齐缺失的EcoR I 识别位点序列aattc,完成克隆连接后,EcoR I 酶切位点依然存在(保留酶切位点)。

具体如下:5' — GAGCCTAGGTGAGTTGGCCG aattc NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN —3'


反向引物设计举例说明(Hind III 酶切开):

反向引物设计举例说明(Hind III 酶切开).png

如上图,载体由Hind III 酶切开,形成5’突出末端:

根据上述设计原则,从3’端开始计算,往回算16bp-25bp(本举例采用了20 bp末端重叠相同序列),加到目的片段特异引物序列前面即可。确保重叠区域的Tm值保持一致且﹥60°C (AT pair = 2°C and GC pair = 4°C)。

反向引物具体如下:5' — CTGCCATCGGATCGTTCGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNN —3'

注意:以上引物设计完成克隆连接后,Hind III 切位点将会消失(不保留酶切位点)。


如果需要保留 Hind III 酶切位点,需要在载体末端20 bp重叠序列和目的片段特异引物序列之间补齐缺失的Hind III 识别位点序列agctt ,Hind III 酶切位点依然存在(保留酶切位点)。

具体如下:5' — CTGCCATCGGATCGTTCGCA agctt NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN —3'



(2). 多个插入片段的克隆引物设计:与载体两端连接的插入片段引物设计方法同单片段设计方法,片段与片段之间连接的插入片段引物设计方法见下图例:

多片段同源臂设计示意图.jpg

* 多个插入片段之间重叠区设计有上述*标记(蓝色和红色)的两种方式,在多片段引物设计时,选择任意一种方式或者两种方式混用均可,保证片段与片段之间有15-25bp 的重叠区。


载体、片段使用量计算:

单片段同源重组反应:

最适克隆载体使用量 = [0.02 × 克隆载体碱基对数] ng ( 0.03 pmol )

最适插入片段使用量 = [0.04 × 插入片段碱基对数] ng ( 0.06 pmol )

多片段同源重组反应:

最适克隆载体使用量 = [0.02 × 克隆载体碱基对数] ng ( 0.03 pmol )

每个片段的最适使用量 = [0.02 × 每个片段碱基对数] ng ( 0.03 pmol )


无缝克隆原理图.png.jpg

产品特点

1、杂质兼容性强:支持直接用酶切原液、PCR原液(目的条带单一)去配制Gibson连接体系。

2、优秀的Gibson设计理念:5-30分钟,在菌体外,即可完成闭合环状质粒的构建,杜绝外源基因的插入。

3、 15分钟可以将一个或者多个长、短PCR扩增片段(平端、A端均可)插入载体。
4、不受载体和插入片段酶切位点的可用性和平端/粘性末端的限制,可以在任意位点进行克隆。
5、无缝克隆,插入点不会引入不需要的碱基序列。
6、 高效、准确,阳性率>95% 。

质量承诺

Gibson原理,比重组酶原理的效率更高!

省时省力的好产品,您值得拥有!