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RNA提取试剂盒,你选对了吗?

发布时间:2020-05-05   浏览次数:

做RNA提取的老司机,看到这个标题,可能会一脸懵:这谁呀…,傻X,这个问题还用讨论吗?

各位同学、老师,请带着下面这几个问题看这篇文章。

1、什么是“总RNA”?“总RNA”的定义是什么?
2、总RNA提取试剂盒提出来的是“总RNA”吗?为什么是2条带而不是3条带?Trizol呢?
3、为什么不能用Trizol提取的RNA去做全转录组测序?
4、全转录组测序该选“总RNA提取试剂盒”?还是该选microRNA提取试剂盒呢?普通转录组测序该怎么选?


一、总RNA的定义
总RNA=mRNA+tRNA+rRNA,即:总RNA就是指mRNA、tRNA、rRNA的总和。这个概念是在还没有发现lmicroRNA的时候的概念,但是却被各大公司所默认,一直延续至今。所以各位可以去各大公司的网站,看一看总RNA提取试剂盒案例提供的RNA电泳图,只有代表总RNA的2条带——28s和18s;代表microRNA的5s带,要不没有,要不很弱。
二、要提mRNA就选总RNA提取试剂盒,或者Trizol。
那么mRNA在哪里呢?从RNA电泳图上能不能看到呢?
真正成熟的mRNA,主要集中在28s和18s之间和上下的荧光背景(一般每条基因mRNA量很少,所以,整体一般看不到明显带,只表现为28s和18s中间和上下的的连续的涂抹带)。
例如下图:28s;18S= 2:1,说明RNA没有降解。连续的涂抹带就是mRNA。不要认为胶图不好看,这才是和下游蛋白翻译直接相关的,成熟的mRNA的表达量。

R513-50-葡萄果实的总RNA
三、要提microRNA就选microRNA提取试剂盒,而不能选Trizol。
相信有很多同学,看到这个论断,下巴都快要惊掉了吧?!为什么不能选Trziol?

请看下面这篇文章:用Trizol提取microRNA,因丢失很多microRNA,造成文章被质疑,最后被撤回。
Molecular Cell, Volume 43, Issue 6, 1005-1014, 16 September 2011 doi:10.1016/j.molcel.2011.07.031
RETRACTED: Cell Adhesion-Dependent Control of MicroRNA Decay
Young-Kook Kim1, Jinah Yeo1, Minju Ha1, Boseon Kim1 and V. Narry Kim1, 2, ,  
1 School of Biological Sciences, Seoul National University, Seoul 151-742, Korea
2 Bioinformatics Institute, Seoul National University, Seoul 151-742, Korea
Corresponding author
This article has been retracted: please see Elsevier Policy on Article Withdrawal (http://www.elsevier.com/locate/withdrawalpolicy).This article has been retracted at the request of the Editor-in-Chief and Author.In this paper, we reported that the levels of specific microRNAs (miRNAs) decrease when cells are grown at low density or when cells are detached from a culture dish. Based on our results, we proposed that some miRNAs are selectively destabilized depending on the adhesion status of the cells. However, in subsequent studies, we discovered that structured miRNAs with low GC content are selectively lost during sample preparation, particularly when a small number of cells is used for RNA preparation using the standard TRIzol protocol (see the Letter to the Editor published in this issue for details). These findings provide an alternative explanation for our original data. While the original data are all reproducible, we are retracting the paper because we feel the main conclusions have been compromised. We apologize for any inconvenience this may have caused.
设想:用Trizol和microRNA试剂盒分别提出来的RNA去做全转录组测序,microRNA数据的多寡,会直接证明这个设想。也为后来的研究者提供理论依据。
值金百特生物成立5周年之际,愿意拿出5000元人民币,用来奖励愿意为探索真理而较真儿的科研工作者。给付标准:第一位发表文章的第一作者。
 

四、全转录组测序就选microRNA提取试剂盒,不能选trizol,也不能选总RNA提取试剂盒。
全转录组测序主要是测mRNA和microRNA。Trizol会丢失很多microRNA,所以不能用。总RNA提取试剂盒的重点是mRNA,是不考虑microRNA的回收率,连RNA胶图都出不来5s带,更不能考虑啦。
金百特生物的microRNA提取试剂盒可以一次性把mRNA、tRNA、rRNA、microRNA都提出来如下图:

R015-50-通用型microRNA提取试剂盒
金百特生物的microRNA提取试剂盒也可以一次性把microRNA和总RNA(mRNA、tRNA、rRNA)分别提出来如下图:

R015-50-通用型microRNA提取试剂盒
R015-50-通用型microRNA提取试剂盒,这款试剂盒的裂解液是Trizol,所以只要Trizol可以提取总RNA的样本,都可以用这款,包括植物、动物、细胞、昆虫等。
如果Trizol无法提取总RNA的样本,特别是多糖多酚的植物样本,请选择R410-50-植物microRNA提取试剂盒,功能同R015-50全世界只有我们一家有这款试剂盒

五、普通转录组测序就选总RNA提取试剂盒,或者trizol。
普通转录组测序主要是测mRNA。所以选总RNA提取试剂盒或者Trizol,均可。
口罩不用戴、研钵不灭菌、粗放操作,20分钟,让高质量RNA与你邂逅!
想更好更快的提取总RNA,以及提RNA的注意事项,请参考:www.gene-better.cn官网首页动态里的文章“不带口罩也能提RNA?!


六、浅谈gDNA过滤器的过滤效率
有同学问:金百特公司的基因组过滤器是不是能把gDNA过滤的一点不剩?
答案:金百特生物的gDNA过滤器能做到和DNase I膜上消化15分-30分钟的效果完全一致
如果有疑问的话,可以做下平行比较,用这两种方法分别提取同一样本RNA,把RNA当模板,用gDNA的引物扩增,PCR,跑电泳,条带是否出来?条带的深浅?是判断两种方法优劣的直接表现。

编后语:
高考作文都没这么认真过!
为认真做事的金百特人点赞!
心里有火,眼里有光!
奔涌吧,金百特!
能把自己感动到落泪的文章一定不会差!
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爆款:
R015-50-通用型microRNA快速提取试剂盒(带gDNA过滤器)——植物、动物组织、细胞、昆虫
R410-50-植物microRNA快速提取试剂盒(带gDNA过滤器,免氯仿,免β-巯基乙醇)——简单植物、多糖多酚植物

R318-50-多糖多酚植物总RNA提取试剂盒(带gDNA过滤器,免氯仿,免β-巯基乙醇)——根、茎、叶、花!多糖多酚样本放心选!作物类样品更没问题!全能型选手!
R513-50-果实种子总RNA提取试剂盒(带gDNA过滤器,免氯仿)——果实、种子、中草药

经费不足的课题组可选这2款:
R013-50-通用型总RNA提取试剂盒(trizol+吸附柱)——动物组织、细胞、作物类叶片、血液、病毒
R011-100-RNAzol(Trizol)——支持全程操作在室温下进行。尽量不裂解核膜的配方,使得RNA更纯!

 
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