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为什么RNeasy mini kit只有2条带?Trizol有3条带?

发布时间:2022-03-25   浏览次数:

一、为什么RNeasy mini Kit只有2条带?

首先我们得知道什么是总RNA?

 

你们也许会说,教课上有讲到的, 顾名思义,总RNA就是所有的RNA,包括:信使RNA(mRNA)、转运RNA(tRNA)、核糖体RNA(rRNA)、microRNA(miRNA)、小分子RNA(主要包括snRNA、scRNA)、非编码RNA(lncRNA)、cirRNA等
 

 

但是,在生产RNA试剂盒的公司眼中,总RNA就是指mRNA、tRNA、rRNA的总和。这个概念是在还没有发现microRNA的时候产生的,但是却被各大公司所默认,一直延续至今。

也就是说在市场上你看到的“总RNA提取试剂盒”,“RNA提取试剂盒”,进口的 RNA Kit,其中的”RNA”是指mRNA,提出来的是这三种RNA(mRNA、tRNA、rRNA)的混合物。

 

所以各位可以去各大公司的网站,看一看,总RNA提取试剂盒案例,所展示的RNA电泳图,只有代表“总RNA”的2条带——28s和18s;代表microRNA的5s带,要不没有,要不很弱。

这就是目前各个公司总RNA提取试剂盒中“总RNA”的概念。

 

                                                     RNeasy mini kit的提出的高质量RNA

GeneBetter同款Kit:

R017-50 动物组织/细胞/昆虫总RNA提取试剂盒 1200元/50次 8折

R019-50 植物总RNA提取试剂盒(免氯仿)1200元/50次  8折

科普一:mRNA在哪里吗?电泳图上能看到吗?


答案:mRNA只占总RNA的1%~5%,点样孔的总RNA低于800ng时,基本看不到,浓度较高时,变现为28S、18S中间以及上下的涂抹带。

不要觉得胶图不好看,其实这才是我们要检测的mRNA(信使RNA),mRNA不是一个固定长度的RNA,而是由不同长度m RNA组成的,一般会大于200nt,所以市面上的RNAkit不关注位于200nt左右的5S带。

 

科普二:为什么说RNA电泳图有2:1的条带,我们就判定其为好的RNA呢?

 

答案:核糖体RNA(rRNA)占总RNA的75~85%,跑电泳时,我们看到rRNA的大片段28S、18S表现为2:1,我们通常认为RNA是完好的,没有降解的。原理是:因为长链的rRNA都没有降解,我们据此推断出:mRNA也应该是完好的。

 

二、为什么Trizol提出来的是3条带?

 

答案:Trizol是通过异丙醇沉淀得到RNA,会沉淀出大部分的小片段RNA,所以会出现5S


图片来源于农科院作物所,Marker左边是invitrogen的trizol;marker右边是金百特的RNAzol。都是上样3ul,由于我们的RNA浓度过高(~5000ng/UL),电泳条带都快分不开了。

 
RNAzol特价:399元/100ml 用不好,赔3倍!

 

三、Trizol提出来的,应该是真正的总RNA(教科书上的定义)了吧?

 

好多人会认为:trizol提出来的是3条带,又叫总RNA提取试剂, 肯定错不了!!!

并且,好多实验室一直都是这么认为的!一直用来做microRNA的qPCR检测呢。

 
答案:错!错!错!

 

请看下图


来源于Qiagen官网(点击翻译网页)miRNeasy Mini kit(217004)的性能优于Trizol

 

GeneBetter/金百特,和Qiagen的miRNeasy Mini kit(217004)同款的试剂盒是:

R015-50 通用型microRNA快速提取试剂盒 2200元/盒 8折 不丢失miRNA的Kit!

适用于动物、普通植物的miRNA的提取、qPCR检测;也适用于mRNA的qPCR检测;还可以用于各种转录组测序。


R015-50提取的细胞(上清吸400ul-500ul,会明显减少蛋白污染)

还有一篇报道


 

结论:Trizol沉淀法会造成小片段RNA的丢失,发论文时可能会遭到主编的质疑!

 


本节完毕

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