发布时间:2022-03-25 浏览次数:次
首先我们得知道什么是总RNA?
但是,在生产RNA试剂盒的公司眼中,总RNA就是指mRNA、tRNA、rRNA的总和。这个概念是在还没有发现microRNA的时候产生的,但是却被各大公司所默认,一直延续至今。
也就是说在市场上你看到的“总RNA提取试剂盒”,“RNA提取试剂盒”,进口的 RNA Kit,其中的”RNA”是指mRNA,提出来的是这三种RNA(mRNA、tRNA、rRNA)的混合物。
所以各位可以去各大公司的网站,看一看,总RNA提取试剂盒案例,所展示的RNA电泳图,只有代表“总RNA”的2条带——28s和18s;代表microRNA的5s带,要不没有,要不很弱。
这就是目前各个公司总RNA提取试剂盒中“总RNA”的概念。
GeneBetter同款Kit:
R017-50 动物组织/细胞/昆虫总RNA提取试剂盒 1200元/50次 8折
R019-50 植物总RNA提取试剂盒(免氯仿)1200元/50次 8折
科普一:mRNA在哪里吗?电泳图上能看到吗?
答案:mRNA只占总RNA的1%~5%,点样孔的总RNA低于800ng时,基本看不到,浓度较高时,变现为28S、18S中间以及上下的涂抹带。
不要觉得胶图不好看,其实这才是我们要检测的mRNA(信使RNA),mRNA不是一个固定长度的RNA,而是由不同长度m RNA组成的,一般会大于200nt,所以市面上的RNAkit不关注位于200nt左右的5S带。
答案:核糖体RNA(rRNA)占总RNA的75~85%,跑电泳时,我们看到rRNA的大片段28S、18S表现为2:1,我们通常认为RNA是完好的,没有降解的。原理是:因为长链的rRNA都没有降解,我们据此推断出:mRNA也应该是完好的。
二、为什么Trizol提出来的是3条带?
答案:Trizol是通过异丙醇沉淀得到RNA,会沉淀出大部分的小片段RNA,所以会出现5S带。
图片来源于农科院作物所,Marker左边是invitrogen的trizol;marker右边是金百特的RNAzol。都是上样3ul,由于我们的RNA浓度过高(~5000ng/UL),电泳条带都快分不开了。
好多人会认为:trizol提出来的是3条带,又叫总RNA提取试剂, 肯定错不了!!!
并且,好多实验室一直都是这么认为的!一直用来做microRNA的qPCR检测呢。
请看下图
来源于Qiagen官网(点击翻译网页)miRNeasy Mini kit(217004)的性能优于Trizol
GeneBetter/金百特,和Qiagen的miRNeasy Mini kit(217004)同款的试剂盒是:
R015-50 通用型microRNA快速提取试剂盒 2200元/盒 8折 不丢失miRNA的Kit!
适用于动物、普通植物的miRNA的提取、qPCR检测;也适用于mRNA的qPCR检测;还可以用于各种转录组测序。
R015-50提取的细胞(上清吸400ul-500ul,会明显减少蛋白污染)
还有一篇报道
结论:Trizol沉淀法会造成小片段RNA的丢失,发论文时可能会遭到主编的质疑!
本节完毕
欢迎入群交流
明星产品推荐:
P418-25 Script III miRNA First Strand Synthesis Kit (加尾法) 2100元/25次 9折
P613-500 miRNA 反转录/荧光定量检测试剂盒(25次RT加尾法/500次qPCR) 3661元/包
详询当地代理商 或 北京金百特